
BOOKS - SCIENCE AND STUDY - Машинное обучение в структурной биологии...

Машинное обучение в структурной биологии
Author: Головин А.В., Пензар Д.Д.
Year: 2022
Format: PDF
File size: 25 MB
Language: RU

Year: 2022
Format: PDF
File size: 25 MB
Language: RU

The book "Machine Learning in Structural Biology" is a comprehensive guide to understanding the power of machine learning in the field of structural biology. The author, a renowned expert in the field, provides a detailed overview of the current state of machine learning techniques and their applications in structural biology, highlighting the potential for these methods to revolutionize our understanding of biological systems. The book begins with an introduction to protein structure and molecular mechanics, providing readers with a solid foundation for understanding the principles of machine learning in this context. The author then delves into the world of quantum chemistry and chemoinformatics, explaining how these disciplines are crucial for analyzing the electronic structure of molecules. This section is particularly useful for those who want to gain a deeper understanding of the mathematical underpinnings of machine learning algorithms. Next, the book explores intermolecular protein-ligand interactions and comparative modeling, showcasing the versatility of machine learning in predicting the properties of complex biological systems. The author also discusses protein-protein interactions, demonstrating how machine learning can be used to study the intricate dance of molecular recognition that drives many biological processes. One of the most exciting aspects of the book is its focus on machine models for calculating the properties of electronic structures of molecules. These models have the potential to revolutionize drug discovery and development, as well as our understanding of disease mechanisms. The author provides a detailed overview of the current state of these models, highlighting their strengths and limitations.
Книга «Машинное обучение в структурной биологии» является всеобъемлющим руководством по пониманию силы машинного обучения в области структурной биологии. Автор, известный эксперт в этой области, дает подробный обзор современного состояния методов машинного обучения и их применения в структурной биологии, подчеркивая потенциал этих методов, чтобы революционизировать наше понимание биологических систем. Книга начинается с введения в структуру белка и молекулярную механику, предоставляя читателям прочную основу для понимания принципов машинного обучения в этом контексте. Затем автор углубляется в мир квантовой химии и хемоинформатики, объясняя, как эти дисциплины имеют решающее значение для анализа электронной структуры молекул. Этот раздел особенно полезен для тех, кто хочет глубже понять математические основы алгоритмов машинного обучения. Далее книга исследует межмолекулярные белок-лигандные взаимодействия и сравнительное моделирование, демонстрируя универсальность машинного обучения в прогнозировании свойств сложных биологических систем. Автор также обсуждает белок-белковые взаимодействия, демонстрируя, как машинное обучение можно использовать для изучения сложного танца молекулярного распознавания, который управляет многими биологическими процессами. Один из самых волнующих аспектов книги - ее направленность на машинные модели расчета свойств электронных структур молекул. Эти модели могут революционизировать открытие и разработку лекарств, а также наше понимание механизмов заболевания. Автор приводит подробный обзор текущего состояния этих моделей, выделяя их сильные стороны и ограничения.
livre « Machine arning in Structural Biology » est un guide complet pour comprendre la force de l'apprentissage automatique dans le domaine de la biologie structurelle. L'auteur, un expert reconnu dans ce domaine, donne un aperçu détaillé de l'état actuel des méthodes d'apprentissage automatique et de leurs applications en biologie structurelle, soulignant le potentiel de ces méthodes pour révolutionner notre compréhension des systèmes biologiques. livre commence par une introduction à la structure des protéines et à la mécanique moléculaire, offrant aux lecteurs une base solide pour comprendre les principes de l'apprentissage automatique dans ce contexte. L'auteur explore ensuite le monde de la chimie quantique et de la chimie, expliquant comment ces disciplines sont essentielles à l'analyse de la structure électronique des molécules. Cette section est particulièrement utile pour ceux qui veulent mieux comprendre les bases mathématiques des algorithmes d'apprentissage automatique. livre étudie ensuite les interactions protéine-ligand intermoléculaires et la modélisation comparative, démontrant l'universalité de l'apprentissage automatique dans la prévision des propriétés des systèmes biologiques complexes. L'auteur discute également des interactions protéine-protéine, démontrant comment l'apprentissage automatique peut être utilisé pour étudier une danse complexe de reconnaissance moléculaire qui contrôle de nombreux processus biologiques. L'un des aspects les plus excitants du livre est son accent sur les modèles de machine de calcul des propriétés des structures électroniques des molécules. Ces modèles peuvent révolutionner la découverte et le développement de médicaments, ainsi que notre compréhension des mécanismes de la maladie. L'auteur donne un aperçu détaillé de l'état actuel de ces modèles, en soulignant leurs points forts et leurs limites.
libro Aprendizaje Automático en Biología Estructural es una guía integral para entender el poder del aprendizaje automático en biología estructural. autor, reconocido experto en la materia, ofrece una visión detallada del estado actual de las técnicas de aprendizaje automático y sus aplicaciones en biología estructural, destacando el potencial de estas técnicas para revolucionar nuestra comprensión de los sistemas biológicos. libro comienza con una introducción a la estructura proteica y la mecánica molecular, proporcionando a los lectores una base sólida para entender los principios del aprendizaje automático en este contexto. autor se adentra entonces en el mundo de la química cuántica y la quimioinformática, explicando cómo estas disciplinas son cruciales para analizar la estructura electrónica de las moléculas. Esta sección es especialmente útil para aquellos que quieren comprender más a fondo los fundamentos matemáticos de los algoritmos de aprendizaje automático. A continuación, el libro explora las interacciones proteína-ligando intermoleculares y la simulación comparativa, demostrando la versatilidad del aprendizaje automático en la predicción de las propiedades de sistemas biológicos complejos. autor también discute las interacciones proteína-proteína, demostrando cómo el aprendizaje automático puede ser utilizado para estudiar la compleja danza del reconocimiento molecular que controla muchos procesos biológicos. Uno de los aspectos más emocionantes del libro es su enfoque en modelos de máquinas para calcular las propiedades de las estructuras electrónicas de las moléculas. Estos modelos pueden revolucionar el descubrimiento y desarrollo de medicamentos, así como nuestra comprensión de los mecanismos de la enfermedad. autor ofrece una descripción detallada del estado actual de estos modelos, destacando sus fortalezas y limitaciones.
O livro «Aprendizagem de máquinas em biologia estrutural» é um guia abrangente para compreender a força do aprendizado de máquinas em biologia estrutural. O autor, um conhecido especialista nesta área, fornece uma visão detalhada do atual estado das técnicas de aprendizagem de máquinas e suas aplicações na biologia estrutural, enfatizando o potencial dessas técnicas para revolucionar a nossa compreensão dos sistemas biológicos. O livro começa com a introdução de proteínas e mecânicas moleculares, fornecendo aos leitores uma base sólida para compreender os princípios do aprendizado de máquinas neste contexto. Em seguida, o autor se aprofundou no mundo da química quântica e da hemoinformática, explicando como essas disciplinas são essenciais para a análise da estrutura eletrônica das moléculas. Esta seção é especialmente útil para aqueles que querem compreender mais a base matemática dos algoritmos de aprendizado de máquina. Mais adiante, o livro explora as interações ligandas entre as camadas e a simulação comparativa, mostrando a versatilidade do aprendizado de máquinas na previsão das propriedades de sistemas biológicos complexos. O autor também discute as interações entre proteínas e proteínas, mostrando como o aprendizado de máquinas pode ser usado para estudar a dança complexa do reconhecimento molecular, que controla muitos processos biológicos. Um dos aspectos mais preocupantes do livro é a sua orientação para modelos de máquinas para calcular as propriedades das estruturas eletrônicas das moléculas. Estes modelos podem revolucionar a descoberta e o desenvolvimento de medicamentos e a nossa compreensão dos mecanismos da doença. O autor apresenta uma visão detalhada do estado atual desses modelos, destacando seus pontos fortes e limitações.
Il libro «Apprendimento automatico in biologia strutturale» è una guida completa alla comprensione del potere di apprendimento automatico in biologia strutturale. L'autore, un noto esperto in questo campo, fornisce una panoramica dettagliata dello stato attuale delle tecniche di apprendimento automatico e della loro applicazione nella biologia strutturale, sottolineando il potenziale di questi metodi per rivoluzionare la nostra comprensione dei sistemi biologici. Il libro inizia con l'introduzione alla struttura proteica e meccanica molecolare, fornendo ai lettori una base solida per comprendere i principi dell'apprendimento automatico in questo contesto. Poi l'autore si approfondisce nel mondo della chimica quantistica e della chemoinformatica, spiegando come queste discipline sono cruciali per l'analisi della struttura elettronica delle molecole. Questa sezione è particolarmente utile per coloro che vogliono comprendere meglio le basi matematiche degli algoritmi di apprendimento automatico. In seguito, il libro esplora le proteine ligandine intercolecolari e la simulazione comparativa, dimostrando la versatilità dell'apprendimento automatico nella previsione delle proprietà dei sistemi biologici complessi. L'autore discute anche delle interazioni proteiche, dimostrando come l'apprendimento automatico possa essere utilizzato per studiare la danza complessa del riconoscimento molecolare, che gestisce molti processi biologici. Uno degli aspetti più preoccupanti del libro è il suo orientamento verso i modelli di calcolo automatico delle strutture elettroniche delle molecole. Questi modelli possono rivoluzionare la scoperta e lo sviluppo di farmaci e la nostra comprensione dei meccanismi della malattia. L'autore fornisce una panoramica dettagliata dello stato attuale di questi modelli, evidenziando i loro punti di forza e i loro limiti.
Das Buch „Maschinelles rnen in der Strukturbiologie“ ist ein umfassender itfaden zum Verständnis der Kraft des maschinellen rnens im Bereich der Strukturbiologie. Der Autor, ein ausgewiesener Experte auf diesem Gebiet, gibt einen detaillierten Überblick über den aktuellen Stand der Methoden des maschinellen rnens und ihrer Anwendung in der Strukturbiologie und unterstreicht das Potenzial dieser Methoden, unser Verständnis biologischer Systeme zu revolutionieren. Das Buch beginnt mit einer Einführung in die Proteinstruktur und Molekularmechanik und bietet den sern eine solide Grundlage, um die Prinzipien des maschinellen rnens in diesem Zusammenhang zu verstehen. Der Autor taucht dann in die Welt der Quantenchemie und Chemoinformatik ein und erklärt, wie diese Disziplinen für die Analyse der elektronischen Struktur von Molekülen entscheidend sind. Dieser Abschnitt ist besonders nützlich für diejenigen, die ein tieferes Verständnis der mathematischen Grundlagen von maschinellen rnalgorithmen erlangen möchten. Als nächstes untersucht das Buch intermolekulare Protein-Ligand-Interaktionen und vergleichende mulationen und zeigt die Vielseitigkeit des maschinellen rnens bei der Vorhersage der Eigenschaften komplexer biologischer Systeme. Der Autor diskutiert auch Protein-Protein-Interaktionen und zeigt, wie maschinelles rnen verwendet werden kann, um den komplexen Tanz der molekularen Erkennung zu untersuchen, der viele biologische Prozesse antreibt. Einer der spannendsten Aspekte des Buches ist sein Fokus auf maschinelle Modelle zur Berechnung der Eigenschaften elektronischer Molekülstrukturen. Diese Modelle könnten die Entdeckung und Entwicklung von Medikamenten sowie unser Verständnis der Krankheitsmechanismen revolutionieren. Der Autor gibt einen detaillierten Überblick über den aktuellen Stand dieser Modelle und hebt ihre Stärken und Grenzen hervor.
Machine arning w biologii strukturalnej jest kompleksowym przewodnikiem do zrozumienia mocy uczenia maszynowego w biologii strukturalnej. Autor, znany ekspert w tej dziedzinie, przedstawia szczegółowy przegląd aktualnego stanu technik uczenia maszynowego i ich zastosowań w biologii strukturalnej, podkreślając potencjał tych technik w celu zrewolucjonizacji naszego zrozumienia systemów biologicznych. Książka rozpoczyna się od wprowadzenia do struktury białka i mechaniki molekularnej, zapewniając czytelnikom solidne podstawy do zrozumienia zasad uczenia maszynowego w tym kontekście. Następnie autor zagłębia się w świat chemii kwantowej i chemoinformatyki, wyjaśniając, jak te dyscypliny mają kluczowe znaczenie dla analizy elektronicznej struktury cząsteczek. Ta sekcja jest szczególnie przydatna dla tych, którzy chcą głębszego zrozumienia matematycznych podstaw algorytmów uczenia maszynowego. Książka bada również intermolekularne interakcje białko-ligand i modelowanie porównawcze, wykazując wszechstronność uczenia maszynowego w przewidywaniu właściwości złożonych systemów biologicznych. Autor omawia również interakcje białko-białko, pokazując, jak uczenie maszynowe można wykorzystać do badania złożonego tańca rozpoznawania molekularnego, który napędza wiele procesów biologicznych. Jednym z najbardziej ekscytujących aspektów książki jest skupienie się na modelach maszynowych do obliczania właściwości struktur elektronicznych cząsteczek. Modele te mogą zrewolucjonizować odkrycie i rozwój leków, a także nasze zrozumienie mechanizmów chorobowych. Autor przedstawia szczegółowy przegląd aktualnego stanu tych modeli, podkreślając ich atuty i ograniczenia.
Machine arning in Structural Biology הוא מדריך מקיף להבנת כוחה של למידת מכונה בביולוגיה מבנית. המחבר, מומחה בעל שם בתחום, מספק סקירה מפורטת של המצב הנוכחי של שיטות למידת מכונה ויישומיהם בביולוגיה מבנית, ומדגיש את הפוטנציאל של טכניקות אלה כדי לחולל מהפכה בהבנתנו את המערכות הביולוגיות. הספר מתחיל בהקדמה למבנה חלבונים ומכניקה מולקולרית, ומספק לקוראים בסיס מוצק להבנת עקרונות למידת מכונה בהקשר זה. המחבר מתעמק בעולם הכימיה הקוונטית והכימואינפורמטיקה ומסביר כיצד תחומים אלה חיוניים לניתוח המבנה האלקטרוני של מולקולות. סעיף זה שימושי במיוחד למי שרוצה הבנה עמוקה יותר של היסודות המתמטיים של אלגוריתמי למידת מכונה. הספר בוחן אינטראקציות בין-מולקולריות של חלבון-ליגנד ומודלים השוואתיים, ומדגים את מידת הלמידה של מכונה בחיזוי התכונות של מערכות ביולוגיות מורכבות. המחבר דן גם באינטראקציות בין חלבון לחלבון, ומדגים כיצד למידת מכונה יכולה לשמש לחקר הריקוד המורכב של זיהוי מולקולרי המניע תהליכים ביולוגיים רבים. אחד ההיבטים המרגשים ביותר של הספר הוא התמקדותו במודלים של מכונות לחישוב התכונות של מבנים אלקטרוניים של מולקולות. מודלים אלה יכולים לחולל מהפכה בגילוי ופיתוח תרופות, כמו גם בהבנתנו את מנגנוני המחלות. המחבר נותן סקירה מפורטת של מצבם הנוכחי של מודלים אלה, תוך הדגשת החוזקות והמגבלות שלהם.''
Yapısal Biyolojide Makine Öğrenimi, yapısal biyolojide makine öğreniminin gücünü anlamak için kapsamlı bir kılavuzdur. Alanında ünlü bir uzman olan yazar, makine öğrenme tekniklerinin mevcut durumu ve yapısal biyolojideki uygulamaları hakkında ayrıntılı bir genel bakış sunarak, bu tekniklerin biyolojik sistemler anlayışımızda devrim yaratma potansiyelini vurgulamaktadır. Kitap, protein yapısına ve moleküler mekaniğe bir giriş ile başlar ve okuyuculara bu bağlamda makine öğrenimi ilkelerini anlamak için sağlam bir temel sağlar. Yazar daha sonra kuantum kimyası ve kemoinformatik dünyasına giriyor ve bu disiplinlerin moleküllerin elektronik yapısını analiz etmek için nasıl kritik olduğunu açıklıyor. Bu bölüm, makine öğrenme algoritmalarının matematiksel temellerini daha iyi anlamak isteyenler için özellikle yararlıdır. Kitap ayrıca moleküller arası protein-ligand etkileşimlerini ve karşılaştırmalı modellemeyi araştırıyor ve makine öğreniminin karmaşık biyolojik sistemlerin özelliklerini tahmin etmedeki çok yönlülüğünü gösteriyor. Yazar ayrıca, protein-protein etkileşimlerini tartışarak, makine öğreniminin birçok biyolojik süreci yönlendiren moleküler tanımanın karmaşık dansını incelemek için nasıl kullanılabileceğini göstermektedir. Kitabın en heyecan verici yönlerinden biri, moleküllerin elektronik yapılarının özelliklerini hesaplamak için makine modellerine odaklanmasıdır. Bu modeller, ilaç keşfi ve geliştirilmesinin yanı sıra hastalık mekanizmaları konusundaki anlayışımızda devrim yaratabilir. Yazar, bu modellerin mevcut durumu hakkında ayrıntılı bir genel bakış sunar, güçlü yönlerini ve sınırlamalarını vurgular.
التعلم الآلي في علم الأحياء الهيكلي هو دليل شامل لفهم قوة التعلم الآلي في علم الأحياء الهيكلي. يقدم المؤلف، وهو خبير مشهور في هذا المجال، لمحة عامة مفصلة عن الحالة الحالية لتقنيات التعلم الآلي وتطبيقاتها في علم الأحياء الهيكلي، مما يسلط الضوء على إمكانات هذه التقنيات لإحداث ثورة في فهمنا للأنظمة البيولوجية. يبدأ الكتاب بمقدمة لبنية البروتين والميكانيكا الجزيئية، مما يوفر للقراء أساسًا صلبًا لفهم مبادئ التعلم الآلي في هذا السياق. ثم يتعمق المؤلف في عالم كيمياء الكم والمعلوماتية الكيميائية، موضحًا كيف أن هذه التخصصات ضرورية لتحليل البنية الإلكترونية للجزيئات. هذا القسم مفيد بشكل خاص لأولئك الذين يريدون فهمًا أعمق للأسس الرياضية لخوارزميات التعلم الآلي. يستكشف الكتاب أيضًا تفاعلات البروتين والرباط بين الجزيئات والنمذجة المقارنة، مما يوضح تعدد استخدامات التعلم الآلي في التنبؤ بخصائص الأنظمة البيولوجية المعقدة. يناقش المؤلف أيضًا تفاعلات البروتين والبروتين، ويوضح كيف يمكن استخدام التعلم الآلي لدراسة الرقص المعقد للتعرف الجزيئي الذي يقود العديد من العمليات البيولوجية. أحد أكثر جوانب الكتاب إثارة هو تركيزه على نماذج الآلة لحساب خصائص الهياكل الإلكترونية للجزيئات. يمكن أن تحدث هذه النماذج ثورة في اكتشاف الأدوية وتطويرها، فضلاً عن فهمنا لآليات المرض. يقدم المؤلف لمحة عامة مفصلة عن الوضع الحالي لهذه النماذج، مع تسليط الضوء على نقاط قوتها وقيودها.
구조 생물학의 기계 학습은 구조 생물학에서 기계 학습의 힘을 이해하기위한 포괄적 인 가이드입니다. 이 분야의 저명한 전문가 인 저자는 기계 학습 기술의 현재 상태와 구조 생물학에서의 응용에 대한 자세한 개요를 제공하여 생물학적 시스템에 대한 이해를 혁신하기위한 이러한 기술의 잠재력을 강조합니다. 이 책은 단백질 구조와 분자 역학에 대한 소개로 시작하여 독자들에게 이러한 맥락에서 머신 러닝 원리를 이해하기위한 견고한 토대를 제공합니다. 그런 다음 저자는 양자 화학 및 화학 정보학의 세계를 탐구하여 이러한 분야가 분자의 전자 구조를 분석하는 데 어떻게 중요한지 설명합니다. 이 섹션은 머신 러닝 알고리즘의 수학적 기초에 대해 더 깊이 이해하려는 사람들에게 특히 유용합니다. 이 책은 또한 분자 간 단백질-리간드 상호 작용 및 비교 모델링을 탐구하여 복잡한 생물학적 시스템의 특성을 예측할 때 기계 학습의 다양성을 보여줍니다. 저자는 또한 단백질-단백질 상호 작용에 대해 논의하여 기계 학습을 사용하여 많은 생물학적 과정을 유발하는 복잡한 분자 인식 댄스를 연구하는 방법을 보여줍니다. 이 책의 가장 흥미로운 측면 중 하나는 분자의 전자 구조의 특성을 계산하기위한 기계 모델에 중점을 둡니다. 이러한 모델은 약물 발견 및 개발뿐만 아니라 질병 메커니즘에 대한 이해를 혁신 할 수 있습니다. 저자는 이러한 모델의 현재 상태에 대한 자세한 개요를 제공하여 강점과 한계를 강조합니다.
構造生物学における機械学習は、構造生物学における機械学習の力を理解するための包括的なガイドです。この分野で著名な専門家である著者は、機械学習技術の現状と構造生物学への応用の詳細な概要を提供し、これらの技術の可能性を強調して生物システムの理解に革命をもたらす。この本は、タンパク質構造と分子力学の紹介から始まり、この文脈における機械学習の原理を理解するための確かな基礎を読者に提供します。次に、量子化学とケモインフォマティクスの世界を掘り下げ、分子の電子構造を解析するためにこれらの分野がどのように重要であるかを説明します。このセクションは、機械学習アルゴリズムの数学的基礎をより深く理解したい人に特に役立ちます。さらに、分子間タンパク質-リガンド相互作用と比較モデリングを検討し、複雑な生体系の特性を予測する際の機械学習の汎用性を実証している。また、タンパク質とタンパク質の相互作用についても論じ、機械学習を用いて多くの生物学的プロセスを駆動する分子認識の複雑なダンスを研究する方法を示している。本書の最もエキサイティングな側面の1つは、分子の電子構造の特性を計算するための機械モデルに焦点を当てることです。これらのモデルは、創薬と開発、ならびに疾患メカニズムの理解に革命をもたらす可能性がある。著者は、これらのモデルの現在の状態の詳細な概要を示し、その強みと限界を強調しています。
「結構生物學的機器學習」書是理解結構生物學領域機器學習力量的全面指南。作者是該領域的著名專家,詳細介紹了機器學習技術的現代狀態及其在結構生物學中的應用,強調了這些技術革新我們對生物系統的理解的潛力。本書首先介紹了蛋白質結構和分子力學,為讀者提供了了解這種情況下機器學習原理的堅實基礎。然後,作者深入研究量子化學和化學信息學的世界,解釋了這些學科對於分析分子的電子結構至關重要。本節對於那些希望更深入地了解機器學習算法的數學基礎的人特別有用。該書進一步探討了分子間蛋白質-配體相互作用和比較建模,證明了機器學習在預測復雜生物系統特性方面的多功能性。作者還討論了蛋白質-蛋白質相互作用,展示了機器學習如何用於研究復雜的分子識別舞蹈,該舞蹈驅動了許多生物學過程。本書最令人興奮的方面之一是它專註於計算分子電子結構特性的機器模型。這些模型可以徹底改變藥物的發現和開發,以及我們對疾病機制的理解。作者詳細介紹了這些模型的當前狀態,突出了它們的優勢和局限性。
